彈力纖維（Verhoeff’s Van Gieson，EVG）染色，彈性纖維廣泛分佈與身體各處，特別在動脈壁、肺泡壁和皮膚中最為豐富。觀察組織內彈性纖維是否有增生或斷裂崩解等。
PTAH(phosphotungstic acid-haematoxylin staining) 磷鎢酸-蘇木紫染色法
PTAH 磷鎢酸-蘇木紫染色法，染劑中大量的磷鎢酸(phosphotungstic acid)，會與蘇木紫(hematoxylin)形成藍色的沉澱色料(lake pigments)，並沉積在橫紋肌、纖維素(fibrin)、細胞核、神經膠細胞等。
Nissl stain 尼氏染色
特殊化學染色的一種，主要藉由Cresyl violet染出腦或脊髓中的nissl body，是做神經研究的一個重要染色。
Alizarin Red S Stain 茜素红染色
Alizarin Red S Stain是一種特殊染色，常用於染色組織中的鈣沉積。
Safranin O Stain 番紅染色
Safranin O Stain是一種特殊染色，它可以被用來檢測軟骨、黏蛋白和肥大細胞的顆粒。
Alcian blue Stain / 阿爾辛藍
Alcian blue Stain是用來染色的酸性多醣，例如葡糖胺聚醣在軟骨和其它身體結構，一些類型的粘多醣對於許多這些靶標，它是用於光學和電子顯微鏡的最廣泛使用的陽離子染料之一。對於石蠟包埋切片和半薄樹脂切片中的光學顯微鏡而言，被這種染料特異性染色的組織部分在染色後變為藍色至藍綠色，被稱為“嗜鹼性”。
Toluidine blue 甲苯胺藍染色
對核酸具有高親和力，具有高DNA和RNA的組織結合， 在一些癌症、過敏性癌症疾病或腸胃道疾病，肥大細胞跟患者的狀況可能會需要了解肥大細胞之間的關係。
Oil Red O 油紅染色
Oil Red 油紅染色，常被使用在脂肪的染色，廣泛的被使用在脂肪肝定性及定量。唯一的限制是須用冷凍切片才能得到較佳的染色效果。
Picro-Sirius Red Stain 天狼星紅染色
常用在確認組織中的膠原纖維的一種特殊組織化學染色(histochemistry)法，膠原纖維在這個染色法下會呈現鮮紅到橘紅的染色性，而背景組織呈現黃色至橘黃色，細胞核則呈現藍黑色。與Masson Trichrome染色都是在組織病理學中被廣泛使用於檢測膠原纖維分佈的一種方法。